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甲基化水平异常是什么意思

甲基化水平异常是什么意思

最佳答案指DNA分子上的甲基基团数量和位置的变化。甲基化是一种化学修饰,通过在DNA分子上添加甲基基团来改变基因的表达,这种修饰可以在基因的启动子区域或其他区域发生,从而影响基因的转录和翻译,因此,甲基化水平异常是指DNA分子上的甲基基团数量和位置的变化。

DNA methylation

最佳答案高等生物的DNA甲基化主要发生胞嘧啶第五位碳原子上。哺乳动物的DNA甲

基化主要发生在对称的CG序列上,基因组中大约70%.80%的CG序列是甲基化的,

然而少量非CG序列的DNA甲基化存在胚胎干细胞中, 非甲基化CG序列主要分布

在基因启动子附近的CG岛 .

植物DNA甲基化的分布与动物存在明显差异,植物DNA甲基化发生在胞嘧啶的三种序列上: 对称的CG和CHG序列

非对称的CHH序列(H=A、T和C) (Henderson and Jacobsen 2007)。且DNA甲基化主要分布在

转座元件和重复序列上 (Zhang et al 2006)。由于不同物种基因组中重复序列和转座子元件的比例不一样,它们的DNA甲基化水平是不一样的。水稻总体甲基化为14.7%,它的CG、CHG、CHH甲基化水平分别39.9%、23.7%、4.7%。

研究表明植物CG、CHG、CHH三种序列的DNA甲基化是由不同的DNA甲基

转移酶催化维持的植物中 CG 序列甲基化通过DNA甲基转移酶 METl

(METHYLTRANSFERASE 1)维持,它与哺乳动物中的 DNMTl 同源; CHG 序列甲基化是通过植物特有的 DNA甲基转移酶CMT3 (CHROMOMETHYLASE 3)维

持; DRM2(DOMAINS REARRANGED METHYLTRANSFERASSE 2)和CMT2

(CHROMOMETHYLASE 2) 共同维持 CHH 甲基化,DRM2在哺乳动物同源基因

为DNMT3,参与RNA介导的DNA甲基化途径(RdDM)负责甲基化的起始。

与哺乳动物不同,植物中DNA甲基化的起始主要是依赖于RNA介导的DNA

甲基化(RdDM)途径(图4),24个碱基的siRNA通过与基因组同源匹配的方式将

DRM2引导到靶位点进行DNA甲基化的起始。RdDM途径需要两个与RNA聚合酶II(PolII) 同源的植物特有的RNA聚合酶:Pol IV和Pol V。Pol IV转录产生的长链RNA(10ng RNA)通过RDR2(RNA.dependent RNA polymerase 2)形成双链RNA,这些长链RNA被DCL3(DICER.LIKE 3)剪切成24nt的siRNA,siRNA与AG04形成复合体通过与Pol V在靶位点转录的RNA结合,介导DRM2在靶位点的DNA甲基化。

植物去甲基化是通过DNA糖基化和碱基切除修复机制进行的。拟南芥的DNA去甲基化酶包括DME(DEMETER)、ROSl(REPRESSOR OF SILENCING 1)、DML2(DEMETER—LIKE 2)和DML3。DME和ROSl是双功能的胞嘧啶糖基化酶,甲基化的胞嘧啶在N.糖苷键被切断释放甲基化的嘧啶基团,然后通过裂解酶活性断裂这个位点两侧的磷酸二酯键,在双链DNA上形成一个单碱基缺口。尽管DME和ROSl糖基化的底物是相同,但它们有不同的生物学功能。DME在配子形成过程中发挥DNA去甲基化酶功能,是印记基因产生的基础,其他的DNA去甲基化酶在营养组织表达,能够去除特定细胞中一些非必须的DNA甲基化。

甲基化概念及功能简述

最佳答案真核生物基因表达受多种机制、多层面的综合调控。基因的DNA序列不发生改变的情况下,基因的表达水平与功能发生改变,并可遗传现象,称为 表观遗传(epigenetic)现象

表观遗传学:调控机体基因表达的最重要途径之一。

如图所示,真核生物基因表达调控层次:1. DNA水平调节;2. 转录水平调节;3. 转录后水平的调节;4. 翻译水平调节;5. 翻译后加工的调节。

然而,表观遗传学的调节机制主要包括 DNA甲基化 组蛋白修饰 非编码RNA作用 等多种形式,其中, DNA甲基化是目前研究的比较清楚的表观遗传修饰方式

真核细胞内甲基化状态有3种:持续的低甲基化状态(如持家基因的甲基化)、诱导的去甲基化状态(如一些发育阶段特异性基因的修饰)和高度甲基化状态(如人类女性细胞内缢缩-失活的X染色体的甲基化)。

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人体内,DNA甲基转移酶主要有四种:DNMT1、DNMT3A、DNMT3B和DNMT3L。

研究证明, 细菌DNA复制起始与DNA甲基化 及DNA与细菌质膜的相互作用 有关 ,DNA甲基化作为一种标签决定了复制起始点,控制了复制起始,使得DNA复制与细胞分裂保持一致;DNA错配修复是细胞增殖过程中纠正DNA复制错误的重要手段。复制后双链DNA在短期内(数分钟)保持半甲基化状态,错配修复系统从而能够区分旧链与新链,为新链中掺入的错误碱基提供了分子标记。

DNA甲基化为非编码区(如内含子等)的长期沉默提供了一种有效的抑制机制。 基因启动区域内CpG位点的甲基化通过三种方式影响基因转录活性 :DNA序列甲基化直接阻碍转录因子的结合;甲基CpG结合蛋白结合到甲基化CpG位点与其他转录抑制因子相互作用;染色质结构的凝集阻碍了转录因子与其调控序列的结合。

在胚胎发育的过程中,基因组范围内的 DNA甲基化水平会发生剧烈的改变 ,其中,改变最为剧烈的是 配子形成期与早期胚胎发育阶段 。错误甲基化模式的建立可能会引起人类疾病,如脆性X染色体综合征。

肿瘤中普遍存在DNA甲基化状态的改变,其特点是总体甲基化水平的降低与局部甲基化水平的升高。在肿瘤细胞中,癌基因处于低甲基化状态而被激活,抑癌基因处于高甲基化状态而被抑制。

参考链接:

一般植物经过一定时间的低温处理,其DNA甲基化,水平怎样变化?

最佳答案在植物中,DNA甲基化是一种常见的表观遗传修饰,这种修饰通常随着环境因素的变化而发生。在低温处理的情况下,植物的DNA甲基化水平可能会有所改变。

在很多植物中,低温可以诱导DNA甲基化水平的增加。这种增加可能发生在基因组的某些区域,这些区域编码的基因可能涉及到对低温的适应性反应。甲基化的增加可能有助于关闭某些基因的表达,从而帮助植物应对低温环境。

然而,也有一些研究表明,在某些植物中,低温处理可能会导致DNA甲基化水平的降低。这种变化可能涉及到植物体内的一系列复杂的信号传导过程,以及DNA甲基化和其他表观遗传修饰之间的相互作用。

总的来说,植物在低温处理下的DNA甲基化水平变化可能因植物种类和具体的低温处理条件而异。这一领域仍需进一步的研究以揭示其中的具体机制和规律。

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